Kloroplast Genomundan psbM ve rpl32 Bölgelerine Ait Verileri Kullanarak Echinophoreae Tribusunun (Apiaceae, Apioideae alt ailesi) Filogenetik Açıdan Araştırılması

Apiaceae familyası dünya çapında 400'den fazla cins ve 3800 tür ile esas olarak kuzey yarımkürede merkezlenmiştir. Apiacaeae familyasının iyi tanınmış bir tribus olan Echinophoreae, esas olarak GB Asya'da yayılış gösteren ve morfolojik olarak iyi tanınan bir gruptur. Bu tribus altı cins içermektedir: Anisosciadium, Dicyclophora, Echinophora, Pycnocycla, Ergocarpon ve Thecocarpus. Ülkemizde ise bu tribuse ait olan Echinophora ve Thecocarpus üyeleri yayılış göstermektedir.Echinophora L. cinsi Apiaceae familyasının ekonomik ve tıbbi öneme sahip cinslerinden biridir. Echinophora cinsi dünya genelinde15 takson ile temsil edilir ve cinsin ülkemizdeki endemizm oranı %50'dir. Bu proje kapsamında, Echinophora ve Thecocarpus cinsinin ülkemizde yayılış gösteren türlerinin kloroplast genomuna ait olan psbM ve rpl32 bölgeleri dizilenecektir. Elde edilen diziler analiz edilecek ve bu iki cinsin filogenetik ilişkisini gösteren dendogramlar oluşturulacaktır.Echinophora cinsine ait türler daha önceki yıllarda arazi çalışmalarında elde edilmiştir. Thecocarpus cinsine ait olan T. carvifolius türü Türkiye'de yayılış göstermekte olup ülkemizden toplanmıştır, T. meifolius türü ise İran'daki herbaryumlardan temin edilecektir. DNA izolasyonu işlemleri DNA izolasyon kiti kullanılarak yapılacaktır. Çalışılan taksonlarda psbM bölgesi için psbM-f ve trnE-r primerleri ve rpl32 bölgesi için de rpl32 ve trnL(UAG) primerleri kullanılarak çoğaltılacaktır. PCR ürünleri dizi analizi hizmet alımı ile gerçekleştirilecektir. DNA dizilerinin işlenmesi içinSequencher 5.4 ve BioEdit programları kullanılacaktır. Nükleotit dizileri Clustal W programı yardımıyla hizalanacak ve 5' ve 3' uçlarındakidiziler gerekiyorsa kesilecektir. Hizalanmış diziler MEGA 6.0 programı ile nexus formatına dönüştürülecektir. Daha sonraPAUP* 4.0a152 programı kullanılarak filogenetik ağaçlar elde edilecektir.