Mısırda Farklı Seviyelerde Bor Uygulaması için Referans Gen ler in Belirlenmesi

Hassasiyeti üretkenliği ve değişken hesaplama olanakları vermesi sebebiyle Reverse transcription quantitative real time PCR RT qPCR yöntemi gen ekspresyon çalışmalarında yaygın olarak kullanılan bir yöntemdir Pfaffl 2004 Fakat bu yöntemin RT qPCR hassas ekspresyon belirleme çalışmalarında kullanılabilmesi ve sonuçlarının doğru değerlendirilebilmesi için normalizasyon amaçlı olarak kullanılmak üzere sabit bir şekilde eksprese olan ifade edilen genlere ihtiyaç duyulmaktadır Doğru bir şekilde normalizasyonu yapılmamış bir genin çalışmalarda kullanılması sonuçları etkileyecek ve hatalı değerlendirmeler yapılmasına sebep olacaktır Bu da hedeflenen mekanizmaların açıklanmasında yanlışlıklara sebebiyet everecektir Bu yüzden sabit bir şekilde transkribe olan referans gen genlerin belirlenmesi gerekmektedir İdeal referans gen içsel kontrol geni ya da referans gen olarak da bilinir çeşitli çevre şartlarına gelişme aşamalarında ve farklı dokularda karşı sabit bir şekilde eksprese olmalı ve ekpresyonu dış faktörlerden etkilenmemelidir Schmittgen ve ark 2000 Thellin ve ark 1999 Orta Anadolu Bölgesi tarımsal üretimin önemli bir merkezi olup ülke ihtiyacı olan yemlik ve endüstriyel amaçlı mısır üretiminin de hızla yaygınlaştığı bir bölgemizdir Bu üretim artışının Konya ovasının sulama suyuna kavuşması ile birlikte KOP projesi belirgin bir şekilde artacağı tahmin edilmektedir Önceki çalışmalar Konya dahil Orta Güney Anadolu bölgesindeki tarım alanlarında tarımsal üretimi önemli ölçüde sınırlayan bor probleminin varlığını göstermiştir Gezgin ve ark 2002 Fakültemizde borla ilgili devam eden tarımsal amaçlı çalışmalar bölge topraklarının yaklaşık 27 sinde bor noksanlığı yaklaşık 18 inde ise bor toksitesi problemlerinin varlığına işaret etmekte olup bu oran toplamda üretim alanının yaklaşık yarısına tekabül etmektedir Dolayısıyla başta tahıllar olmak üzere bölgede yetiştirilen bitkilerin bordan olumsuz etkilenmemesi için çalışmaların artarak sürdürülmesi gerekmektedir Bu çalışmada çeşitli bor dozları uygulanmış mısır bitkisinde belirlenen bazı genlerin ekpresyon düzeylerine qRT PCR yöntemiyle bakılarak ideal referans gene karar verilmeye çalışılmıştır Elde edilecek sonuçlar ile borun halen yeni kaşfedilmeye başlanan etki mekanizmalarının aydınlatılmasına katkı sağlanması hedeflenmiştir